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GENÓMICA FUNCIONAL EN CÁNCER DE MAMA:
ROL DE LOS ARN LARGOS NO CODIFICANTES EN LA PROGRESIÓN DE LA ENFERMEDAD

seminario 26
Jueves 7 de junio, de 12:00 h a 13:00 h, Aula de Producción chica (2do nivel)

A cargo del Dr. Martin C. Abba.

Centro de Investigaciones Inmunológicas Básicas y Aplicadas (CINIBA)
Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de La Plata (UNLP).


El Carcinoma Ductal In Situ (CDIS) es una lesión neoplásica local no invasiva y precursora de los Carcinomas Ductales Infiltrantes (CDI). Se estima que un tercio de dichas lesiones tendrían el potencial de progresar a CDI si no son tratadas debidamente. Actualmente se desconoce la razón por la cual sólo algunos CDIS progresan al estadio invasivo.
En el presente estudio se realizó la caracterización molecular del exoma, metiloma y transcriptoma de CDIS de alto grado así como la identificación del rol funcional de ARNlnc (ARN largo no codificantes) involucrados con la progresión tumoral. Identificamos dos subgrupos de CDIS, uno de alto riesgo de progresión tumoral y otro de riesgo moderado, que se diferencian por sus subtipos intrínsecos, índice proliferativo, respuesta inmune y diversas vías de señalización celular.
Entre los hallazgos más relevante se pudo identificar un grupo de 193 ARNlnc diferencialmente expresados entre muestras normales de mama y CDIS(p < 0.01, FDR < 0.01). El análisis de enriquecimiento funcional permitió identificar funciones asociadas a la regulación del ciclo celular, las vías de señalización de TP53, ERBB y diversas MAPKs.
Se identificaron 3 ARNlnc intergénico con valor pronóstico independiente de receptores hormonales (ER/PR), grado tumoral y el estatus ganglionar, en muestras de pacientes con carcinomas ductales infiltrantes. Finalmente evaluamos el efecto fenotípico de la sobreexpresión y el silenciamiento de dichos ARNlnc en líneas celulares de mama, complementando con análisis transcriptómicos (RNA-Seq) y proteómicos (RNA-pull down, TAP-MS) para identificar las vías de señalización en las cuales se encuentran involucrados.



Palabras clave: cáncer de mama, genómica funcional, ARN largos no codificantes, progresión.



Más información: mcabba@gmail.com

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